DeepChek® Assay Tüm Genom HIV-1 Genotiplendirme

DeepChek^® Assay Tüm Genom HIV-1 Genotiplendirme

DeepChek<sup>®</sup> Assay Tüm Genom HIV-1 Genotiplendirme

Giriş

DeepChek^® Assay Tüm Genom HIV-1 Genotiplendirme, plazma, serum veya tam kan örneklerinden izole edilen girdı RNA'sından insan immün yetmezlik virüsü tip 1 (HIV 1)’in tüm genomunun çoğaltılması için kullanılmak üzere tasarlanmıştır. Klinik örneklerde HIV-1 saptandığında, bu kit HIV-1 hedef genlerinde (ör. ters transkriptaz, proteaz, integrase, zarf vb.) dirençle ilişkili mutasyonların belirlenmesi yoluyla antiviral direncin tespitine yardımcı olabilir.

Özellikler

z2 rt-PCR adımı: HIV-1 pozitif hastalardan elde edilen RNA kullanılarak test yapılır, ardından NGS uygulanır.
İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 (HIV-1)’in tüm genomunun çoğaltılması için kullanılır; HIV-1 hedef genlerinde (yeni giriş ve kapsid inhibitörleri dahil) antiviral direnç ile ilişkili mutasyonların belirlenmesine olanak sağlar.
Kapsayıcılık: M grubu suşlarından (A1, A2, B, C, D, F1, F2, G, H, J, K ve L) tüm temsilci HIV-1 alt tiplerini mükemmel şekilde kapsar.
LoD: 25.000 cp/mL
Roche MagNA Pure 24 cihazı ve reaktifleri, Thermo Fisher Scientific ProFlex PCR Sistemi (3 x 32 modeli) ve Illumina iSeq-100 cihazı (24 örnek çalıştırma) ile doğrulanmıştır.
Diğer manyetik boncuk RNA izolasyon cihazları ve reaktifleri, ≥ 1°C/s rampa hızına sahip herhangi bir PCR termal döngüleyici ve NGS cihazları ile uyumlu olmalıdır.
48 / 96 ve 384 örnek çalıştırmaları ile uyumlu olmalı; test kesim değerine ulaşmak için ampikonlarda en az 1000 okuma ortalaması ve Phred Kalite Skoru Q30>%80 (veya eşdeğeri) sağlanmalıdır.
Tek tuşla veri analizi: ABL DeepChek^® yazılımı (Tüm Genom HIV-1, REF S-22-05 (WHM)) kullanılarak doğrulanmıştır. HIV-1’e özel diğer NGS analiz yazılımları ile de uyumlu olmalıdır.
Aynı termal döngüleme programı beş (5) ayrı kuyucukta.
Kapsama: ~ 9600 bp
Ampikon sayısı: 5x ~700 ila 3500 bp

SANGER Dizileme için (Viroscore® CE-IVD)

Rapor Örnekleri

Sipariş Bilgileri